Usted juega el Juan misterioso, conocido como Spartan-117 y el maestro Cheif, un suboficial del Jefe Maestro en la Corp de espacio de las Naciones Unidas del siglo 26. Eres el último de un grupo genéticamente mejorado de súper soldados del proyecto Spartan II. Como el último de estos super soldados solo usas el Mjolnir traje mejorado que aumenta su destreza física a través de la asistencia del motor. Que es rápidamente sacó de un congelador criogénico un día para encontrar que el barco que ha estado viajando por el espacio en el pilar de otoño, es atacado por el Covenant (un conglomerado de varias especies de extraterrestres que han declarado la guerra a la raza humana después de su primer establecimiento intergaláctica se formó) y fueron convocados por el capitán. Al llegar a la oficina puede acepta una pistola y un programa de AI y tienen la tarea de la protección de la IA ya que conoce la ubicación de la tierra. Después de la batalla a través de la nave y dejando en una cápsula de escape aterrizar en un mundo misterioso anillo. Después de muchos días en el mundo anillo encontrará que el planeta está infestado de otra especie de alien y debe establecer una tarea gigantesca para destruir el planeta para proteger a la galaxia...