El Dr. Hal Emmerich, apodado Otacon debido a su afición de anime, aparece por primera vez en Metal Gear Solid como empleado ArmsTech que diseñó el Metal Gear REX. Después de ser rescatado por la serpiente de los Ninja, comienza a ayudarlo cuando se da cuenta de que REX está siendo utilizado por los terroristas para lanzar un nuevo tipo de misil nuclear. Su ayuda es fundamental para la victoria de la serpiente, pero a un costo: se ve obligado a ver serpiente ejecutar Sniper Wolf, una mujer que había desarrollado un flechazo en. Kojima afirma que él creó Otacon como su forma de glorificar el estereotipo otaku por tener un personaje que lucha contra a los terroristas con su intelecto, en lugar de su fuerza. Según Kojima, la idea original de Otacon era hacerle 'más pesado, con un gorro y la programación mientras se come una barra de chocolate'. Sin embargo, el diseño Shinkawa hizo por el personaje era una esbelta en su lugar.
En Metal Gear Solid 2, Otacon y Solid Snake forma de filantropía, una organización de lucha contra la proliferación dedicada a la erradicación de todos los engranajes de Metal. Durante el capítulo petrolero, Otacon nuevamente apoya serpiente vía el codec y es el encargado de guardar los progresos del jugador. Más tarde aparece en el capítulo de la planta, que se infiltró en la instalación de concha grande con serpiente para salvar a su hermanastra Emma, que se encuentra entre los rehenes. Trágicamente, Emma es gravemente herida por Vamp y más tarde muere en brazos de Otacon. Él luego transporta a los rehenes sobrevivientes a un lugar seguro y luego brinda apoyo a Raiden vía codec para el resto del juego. Diseñador de personajes plomo Yoji Shinkawa declaró en una entrevista que Otacon fue diseñada para que pareciera un poco 'más fuerte' que hizo en Metal Gear Solid.
Aunque Otacon mismo no aparece en Metal Gear Solid 3 (el juego en la década de 1960), su abuelo (que era parte del proyecto Manhattan) es mencionado en una llamada de radio entre Naked Snake y Sigint (aunque Sigint es incapaz de recordar su nombre correctamente) y aparece en una fotografía junto al diseñador de armas ruso Aleksandr Leonovitch Granin.
Otacon aparece en Metal Gear Solid 4, sigue prestando su apoyo a serpiente. Construye con Sunny (hija de Olga) un compañero robótico de serpiente llamado Metal Gear Mk. II, que él controla remotamente. El MK. II está tomado de un personaje robótico del mismo nombre en Snatcher. Se convierte en una relación romántica con Naomi Hunter a través del curso de la historia aunque nuevamente pierde le a circunstancias ajenas a su voluntad, así que le obligó nuevamente a presenciar la muerte de una mujer que le importaba. En la coda de MGS4, Otacon dice serpiente que él y Sunny vivirá con serpiente para el resto de su vida, para servir como testigos de su existencia.
Otacon también es visto con equipo de Solid Snake en Super Smash Bros Brawl.
