Kay y Jay se reúnen para ofrecer nuestro mejor, último y sólo una línea de defensa contra una siniestra seductora que nivela el reto más difícil aún para el MIB irrealizada misión: proteger la tierra de la escoria del universo. Han pasado cuatro años desde que los agentes buscan alien evitó un desastre intergaláctico de proporciones épicas. Y ahora es una carrera contra el reloj como debe convencer a Jay Kay-que no sólo ha absolutamente ningún recuerdo de su tiempo pasado con los hombres de negro, pero es también el único ser viviente persona dejó con la experiencia necesaria para salvar la galaxia-para reunirse con el MIB antes de que la tierra se somete a la destrucción final.