En esta secuela de la aventura extrema los genios del bebé se encuentran en el centro de un nefasto régimen liderado por el poderoso magnate Bill Biscane. Unirse a los bebés en su batalla contra el mal es un legendario bebé llamado Kahuna. Parte espía ultra-cool, parte superhéroe, Kahuna se une a los bebés Archie, Finkleman, Alex y Rosita en una carrera contra el tiempo para detener al villano Biscane de usar su sistema de satélites de estado-of-the-art para controlar las mentes de la población mundial.