El mundo se ha convertido en un yermo desolado tras el incidente de Racoon City. El Virus-T se propago por el globo infectando a la población mundial y afectando a las plantas las cuales se han deteriorado generando así una desertificación masiva y grandes sequías.
Años después del incidente, Alice (Milla Jovovich) sigue huyendo en solitario mientras trata de derrotar a la Corporación Umbrella dirigida por Albert Wesker (Jason O'Mara).
Mientras tanto en un laboratorio secreto de Umbrella, el Doctor Isaacs (Iain Glen) realiza experimentos con clones de Alice en un intento de replicar la condición de simbiosis que ella tiene con el Virus-T para así desarrollar una cura aunque lo que conseguirá es una nueva casta de super zombies mas rápidos y mas inteligentes a los que puede llegar a controlar.
