Tras la emboscada en el Arcadia, Alice (Milla Jovovich) despierta en una simulación de una vida perfecta donde esta casada y con hijos, en la que todo transcurre con normalidad hasta que se inicia el brote del Virus-T. Descubrirá que en realidad ha estado encerrada en otro de los complejos secretos de la Corporación Umbrella.
El centro es un gran complejo de pruebas de armas biológicas, donde hacían experimentos de campo del Virus-T en entornos que simulan algunas de las ciudades mas importantes del mundo. Alice intentara escapar del centro dominado por otra Reina Roja mientras esta lanza hordas de zombies para acabar con ella.